- Nazwa przedmiotu:
- Zaawansowane techniki przetwarzania obrazowych danych medycznych
- Koordynator przedmiotu:
- dr inż. Krzysztof Mikołajczyk, prof. nzw. dr hab. inż. Krzysztof Kałużyński
- Status przedmiotu:
- Fakultatywny ograniczonego wyboru
- Poziom kształcenia:
- Studia II stopnia
- Program:
- Inżynieria Biomedyczna
- Grupa przedmiotów:
- Przedmioty techniczne - zaawansowane
- Kod przedmiotu:
- ZMO
- Semestr nominalny:
- 4 / rok ak. 2018/2019
- Liczba punktów ECTS:
- 4
- Liczba godzin pracy studenta związanych z osiągnięciem efektów uczenia się:
- 30 godz wykład,
15 godz laboratorium,
15 godz przygotowanie do wykładu,
3 godz konsultacje,
14 godz przygotowanie do laboratorium i sprawozdania,
 10 godz przygotowanie do egzaminu
Razem 87 godz - 4 ECTS
- Liczba punktów ECTS na zajęciach wymagających bezpośredniego udziału nauczycieli akademickich:
- 30 godz wykład,
15 godz laboratorium,
3 godz konsultacje
Razem 48 godz - 2 ECTS
- Język prowadzenia zajęć:
- polski
- Liczba punktów ECTS, którą student uzyskuje w ramach zajęć o charakterze praktycznym:
- 15 godz laboratorium,
14 godz przygotowanie do laboratorium i sprawozdania
Razem  29 godz - 1 ECTS
- Formy zajęć i ich wymiar w semestrze:
- 
            
                - Wykład30h
- Ćwiczenia0h
- Laboratorium15h
- Projekt0h
- Lekcje komputerowe0h
 
- Wymagania wstępne:
- Znajomość podstaw przetwarzania sygnałów, podstaw obrazowania medycznego, kursu matematyki  i statystyki
- Limit liczby studentów:
- 36
- Cel przedmiotu:
- Przekazanie wiedzy nt.  zaawansowanych metod obrazowania ultradźwiękowego i tomograficznego, metod przetwarzania i analizy danych uzyskanych tymi technikami.
- Treści kształcenia:
- Progowanie. Analiza histogramu. Rozrost regionu. Wododziały. Aktywne modele.
Filtracja krawędziowa. Łączenie regionów. Aktywne kontury.
Aproksymacja powierzchni segmentu. Metoda „Marching cubes“. Upraszczanie i modyfikacja siatek.
Widzenie steroskopowe. Renderowanie powierzchni. Projekcja maksymalnej / minimalnej intensywności. Renderowanie objętości.
Algorytmy analityczne: metoda momentów. Algorytmy iteracyjne: metoda mapy dystansów, wariancji ilorazu gęstości, informacji wzajemnej. Wizualizacja danych multimodalnych algorytmy 2D i 3D.
Metody estymacji prędkości przepływu krwi, ich właściwości i ograniczenia. Obrazowanie CFM, TVI/TDI. Zastosowania.
Badanie właściwości mechanicznych tkanek. Elastografia ultradźwiękowa. Metody estymacji przemieszczeń i odkształceń. Zastosowania.
Obrazowanie z emisją kodowaną. Obrazowanie tłumienia fali ultradźwiękowej.
Laboratorium
Segmentacja struktuktur tkankowych w danych PET i CT. 
Konturowanie jako metoda tworzenia regionów zainteresowania (ROI).
Iteracyjne metody dopasowania danych 3D.
Wizualizacja 3D.
Estymacja przemieszczeń i odkształceń.
- Metody oceny:
- Wykład - egzamin
Laboratorium - zaliczenie na podstawie sprawdzianów i sprawozdań
- Egzamin:
- tak
- Literatura:
- W.Malina, M.Smiatacz  Metody cyfrowego przetwarzania obrazów, Exit 2005
R.Tadeusiewicz, P.Korohoda Komputerowa analiza i przetwarzanie obrazów, Kraków  Wydawnictwo Fundacji Postępu Telekomunikacji, 1997
Zieliński T.P. Cyfrowe przetwarzanie sygnałów, WKiŁ 2005
Jensen J.A. Estimation of Blood Velocities using Ultrasound - a Signal Processing Approach, Cambridge University Press, 1996
Sliwiński A. Ultradźwięki i ich zastosowania, WNT, 2001
- Witryna www przedmiotu:
- nie istnieje
- Uwagi:
- brak
Efekty uczenia się
    Profil ogólnoakademicki - wiedza
                    - Charakterystyka ZTPDM_W01
- Zna algorytmy segmentacji medycznych danych tomograficznych
 Weryfikacja: Egzamin
 Powiązane charakterystyki kierunkowe: 
                        K_W01, K_W03
 Powiązane charakterystyki obszarowe: 
                        I.P7S_WG
- Charakterystyka ZTPDM_W02
- Zna metody geometrycznego dopasowania medycznych obrazów multimodalnych.
 Weryfikacja: Egzamin
 Powiązane charakterystyki kierunkowe: 
                        K_W01, K_W03
 Powiązane charakterystyki obszarowe: 
                        I.P7S_WG
- Charakterystyka ZTPDM_W03
- Zna metody wizualizacji wolumetrycznych danych obrazowych
 Weryfikacja: egzamin
 Powiązane charakterystyki kierunkowe: 
                        K_W01, K_W03
 Powiązane charakterystyki obszarowe: 
                        I.P7S_WG
- Charakterystyka ZTPDM_W04
- Zna metody estymacji prędkości i przemieszczeń stosowane w badaniach ultradźwiękowych
 Weryfikacja: Egzamin
 Powiązane charakterystyki kierunkowe: 
                        K_W01, K_W03
 Powiązane charakterystyki obszarowe: 
                        I.P7S_WG
Profil ogólnoakademicki - umiejętności
                    - Charakterystyka ZTPDM_U01
- Potrafi przeanalizować i dobrać odpowiednią metodę geometrycznego dopasowania danych tomograficznych 
 Weryfikacja: Laboratorium
 Powiązane charakterystyki kierunkowe: 
                        K_U01, K_U07, K_U11
 Powiązane charakterystyki obszarowe: 
                        I.P7S_UK, I.P7S_UW, III.P7S_UW.4.o, III.P7S_UW.1.o, III.P7S_UW.3.o
- Charakterystyka ZTPDM_U02
- Potrafi zaimplementować algorytmy filtracji i segmentacji w języku Java lub środowisku Matlab
 Weryfikacja: Laboratorium
 Powiązane charakterystyki kierunkowe: 
                        K_U01, K_U07, K_U11
 Powiązane charakterystyki obszarowe: 
                        I.P7S_UK, I.P7S_UW, III.P7S_UW.4.o, III.P7S_UW.1.o, III.P7S_UW.3.o
- Charakterystyka ZTPDM_U03
- Potrafi dobrac parametry i przeprowadzić estymację przemieszczeń i odkształceń na podstawie danych ultradźwiękowych
 Weryfikacja: Laboratorium
 Powiązane charakterystyki kierunkowe: 
                        K_U07, K_U11, K_U01
 Powiązane charakterystyki obszarowe: 
                        I.P7S_UW, III.P7S_UW.4.o, III.P7S_UW.1.o, III.P7S_UW.3.o, I.P7S_UK
Profil ogólnoakademicki - kompetencje społeczne
                    - Charakterystyka ZTPDM_K01
- Potrafi pracować w zespole
 Weryfikacja: laboratorium
 Powiązane charakterystyki kierunkowe: 
                        K_K04, K_K05
 Powiązane charakterystyki obszarowe: 
                        I.P7S_KR