Drukuj Eksport do pliku (MS Word)
Nazwa przedmiotu:
Biologia systemów
Koordynator przedmiotu:
dr Małgorzata Adamczyk
Status przedmiotu:
Obowiązkowy
Poziom kształcenia:
Studia II stopnia
Program:
Biotechnologia
Grupa przedmiotów:
Obowiązkowe
Kod przedmiotu:
-
Semestr nominalny:
2 / rok ak. 2015/2016
Liczba punktów ECTS:
2
Liczba godzin pracy studenta związanych z osiągnięciem efektów uczenia się:
-
Liczba punktów ECTS na zajęciach wymagających bezpośredniego udziału nauczycieli akademickich:
-
Język prowadzenia zajęć:
polski
Liczba punktów ECTS, którą student uzyskuje w ramach zajęć o charakterze praktycznym:
-
Formy zajęć i ich wymiar w semestrze:
  • Wykład15h
  • Ćwiczenia0h
  • Laboratorium0h
  • Projekt15h
  • Lekcje komputerowe0h
Wymagania wstępne:
-
Limit liczby studentów:
-
Cel przedmiotu:
Celem zajęć jest zapoznanie studentów z koncepcją podejścia biologii systemowej w badaniach z wykorzystaniem replik procesów biologicznych in silico.
Treści kształcenia:
Biologia systemów jest odpowiedzią na konieczność badania procesów biologicznych nie jako izolowanych, fragmentarycznych zjawisk, lecz całościowo poprzez skonsolidowanie wszystkich właściwości systemu, jakim jest żywa komórka. Wykład zawiera informacje o najnowszych zdobyczach technologicznych ostatnich lat, które umożliwiły wysokoprzepustowe globalne, ilościowe i jakościowe analizy genomiczne, transkryptomiczne, proteomiczne oraz metabolomiczne. Przedstawione zostaną rodzaje danych używane w modelowaniu komputerowym oraz konstrukcja modeli na użytek analizy sieci regulacji transkrypcyjne, przekazywania sygnałów komórkowych i ścieżek metabolicznych. Omówione zostaną modele statyczne, kinetyczne i modele na skalę genomową wraz z ich zastosowaniem. Studenci zapoznają się z przykładowym oprogramowaniem wykorzystywanym do modelowania. Zostaną omówione komponenty modeli oraz przedstawiona matematyczna reprezentacji systemów biologicznych. Zajęcia laboratoryjne bedą okazją do skorzystania z baz danych modeli, jak również ich analizy modeli, diagnostyki stabilności i przeprowadzenia symulacji komputerowych. Wykład zawiera informacje na temat roli biologii systemowej w modelowaniu chorób metabolicznych człowieka, w inżynierii metabolicznej mikroorganizmów, wspomaganej biologią systetyczną, na użytek różnych gałęzi biotechnologii.
Metody oceny:
Do zaliczenia przedmiotu wymagane jest uzyskanie 50% z egzaminu teoretycznego i 50% z testu praktycznego
Egzamin:
nie
Literatura:
E.O. Voit A first course in systems biology, 2013 Garland Science E. Klipp Systems Biology, A Textbook, 2009, Wiley-VCH B.O. Palsson, Systems Biology. Properties of reconstructed networks, 2008, Cambridge University Press iGEM Warsaw Team, Biologia Syntetyczna- mozliwości i wyzwania, Wydawnictwo Uniwersytet Warszawski, 2015 oraz najnowsze publikacje.
Witryna www przedmiotu:
-
Uwagi:
-

Efekty uczenia się

Profil ogólnoakademicki - wiedza

Efekt W01
Posiada szczegółową wiedzę z zakresu modelowania bioprocesów i regulacji procesów biotechnologicznych
Weryfikacja: Egzamin + wysłanie odpowiedzi na pytania do zajęć
Powiązane efekty kierunkowe: K_W09
Powiązane efekty obszarowe: T2A_W06
Efekt W02
Posiada szczegółową wiedzę z zakresu biologii komórki
Weryfikacja: Egzamin + wysłanie odpowiedzi na pytania do zajęć
Powiązane efekty kierunkowe: K_W03
Powiązane efekty obszarowe: T2A_W05

Profil ogólnoakademicki - umiejętności

Efekt U01
Potrafi pozyskiwać i rozumie informacje z literatury, baz danych i innych źródeł także w języku angielskim lub innym języku obcym; potrafi interpretować uzyskane informacje, oraz oceniać ich rzetelność i wyciągać z nich wnioski, formułować i wyczerpująco uzasadniać opinie
Weryfikacja: Egzamin + wysłanie odpowiedzi na pytania do zajęć
Powiązane efekty kierunkowe: K_U01
Powiązane efekty obszarowe: T2A_U01, T2A_U05, T2A_U10
Efekt U02
Posługuje się poprawnie terminologią i nomenklaturą stosowaną w chemii, biologii, biochemii, enzymologii, również w języku angielskim
Weryfikacja: Egzamin + wysłanie odpowiedzi na pytania do zajęć
Powiązane efekty kierunkowe: K_U03
Powiązane efekty obszarowe: T2A_U01, T2A_U03, T2A_U06
Efekt U03
Potrafi posługiwać się podstawowymi technikami informacyjno-komunikacyjnymi, w tym programami komputerowymi wspomagającymi realizację zadań inżynierskich z zakresu biotechnologii
Weryfikacja: Egzamin + wysłanie odpowiedzi na pytania do zajęć
Powiązane efekty kierunkowe: K_U07
Powiązane efekty obszarowe: T2A_U07

Profil ogólnoakademicki - kompetencje społeczne

Efekt K01
Potrafi myśleć i działać w sposób kreatywny i przedsiębiorczy
Weryfikacja: Egzamin + wysłanie odpowiedzi na pytania do zajęć
Powiązane efekty kierunkowe: K_K02
Powiązane efekty obszarowe: T2A_K06