- Nazwa przedmiotu:
- Zaawansowane metody biologii molekularnej w bioanalityce
- Koordynator przedmiotu:
- prof. dr hab. Magdalena Boguta
- Status przedmiotu:
- Obowiązkowy
- Poziom kształcenia:
- Studia II stopnia
- Program:
- Biotechnologia
- Grupa przedmiotów:
- Obowiązkowe
- Kod przedmiotu:
- brak
- Semestr nominalny:
- 2 / rok ak. 2012/2013
- Liczba punktów ECTS:
- 3
- Liczba godzin pracy studenta związanych z osiągnięciem efektów uczenia się:
- 1. godziny kontaktowe 30 h, w tym:
a) laboratorium
b) 3 testy po 20 min
3. Przygotowanie materiałów, nauka samodzielna 30 h
Opracowanie wyników laboratoryjnych w formie raportu końcowego 20 h
Razem nakład pracy studenta: 80h, co odpowiada 3 punktom ECTS.
- Liczba punktów ECTS na zajęciach wymagających bezpośredniego udziału nauczycieli akademickich:
- 1. Laboratorium
2. 3 testy po 20 min + sprawdzenie raportu końcowego
Razem: 30 h, co odpowiada 1 punkt ECTS.
- Język prowadzenia zajęć:
- polski
- Liczba punktów ECTS, którą student uzyskuje w ramach zajęć o charakterze praktycznym:
- Laboratorium 30h (1 punkt ECTS).
- Formy zajęć i ich wymiar w semestrze:
-
- Wykład0h
- Ćwiczenia0h
- Laboratorium0h
- Projekt0h
- Lekcje komputerowe0h
- Wymagania wstępne:
- Biochemia, Mikrobiologia, Biologia molekularna, Inżynieria genetyczna.
- Limit liczby studentów:
- brak
- Cel przedmiotu:
- Po ukończeniu kursu student powinien:
• mieć poszerzoną wiedzę teoretyczną na temat biologii molekularnej
- Treści kształcenia:
- Podczas ćwiczeń studenci nadeksprymują i oczyszczą drożdżowe rekombinowane białko Mrf1 z dołączonym znaczikiem histydynowym (6HIS). Białko Mrf1 jest mitochondrialnym czynnikiem terminacji translacji, niezbędnym do zachowania kompetencji oddechowej. Studenci samodzielnie wykonają wszystkie etapy niezbędne do uzyskania białka rekombinowanego począwszy od projektowania eksperymentu z użyciem narzędzi bioinformatycznych, poprzez klonowanie genu, nadekspresję białka jego oczyszczanie kończąc na analizie czystości produktu.
Studenci wysłuchają wykładów na temat:
1. Systemy nadekspresji białek rekombinowanych.
2. Zarys metod oczyszczania białek rekombinowanych.
3. Zastosowanie białek rekombinowanych w przemyśle i medycynie
W trakcie ćwiczeń będą wykorzystywać następujące techniki:
- reakcja PCR;
- trawienie DNA enzymami restrykcyjnymi;
- ekektoforeza DNA w żelu agarozowym;
- ekektoforeza białek w żelu poliakrylamidowym w warunkach denaturujących (SDS-PAGE);
- detekcja białek – barwienie błękitem Coomasie;
- transformacja bakterii;
- izolacja plazmidowego DNA z bakterii;
- hodowla bakterii w warunkach indukcji;
- chromatografia powinowactwa z użyciem Nikiel-agarozy.
- Metody oceny:
- kolokwium
- Egzamin:
- tak
- Literatura:
- Publikacje przekazane przez prowadzących
- Witryna www przedmiotu:
- ch.pw.edu.pl
- Uwagi:
Efekty uczenia się
Profil ogólnoakademicki - wiedza
- Efekt W01
- Posiada szczegółową wiedzę z zakresu biologii komórki
Weryfikacja: testy
Powiązane efekty kierunkowe:
K_W03
Powiązane efekty obszarowe:
T2A_W05
- Efekt W02
- Poszerzona wiedza z zakresu biologii komórki
Weryfikacja: testy
Powiązane efekty kierunkowe:
K_W06
Powiązane efekty obszarowe:
T2A_W02, T2A_W03, T2A_W04
Profil ogólnoakademicki - umiejętności
- Efekt U01
- Posiada umiejętność realizacji prostych zadań badawczych pod opieką opiekuna naukowego
Weryfikacja: Raport końcowy
Powiązane efekty kierunkowe:
K_U08
Powiązane efekty obszarowe:
T2A_U05, T2A_U08
- Efekt U02
- Potrafi wyjaśniać podstawy teoretyczne procesów biotechnologicznych
Weryfikacja: Raport końcowy
Powiązane efekty kierunkowe:
K_U11
Powiązane efekty obszarowe:
T2A_U08, T2A_U11
- Efekt U03
- Posługuje się podstawowymi technikami laboratoryjnymi w zakresie biologii molekularnej
Weryfikacja: Raport końcowy
Powiązane efekty kierunkowe:
K_U12
Powiązane efekty obszarowe:
T2A_U10, T2A_U11
Profil ogólnoakademicki - kompetencje społeczne
- Efekt K01
- Potrafi myśleć i działać w sposób kreatywny i przedsiębiorczy
Weryfikacja: testy
Powiązane efekty kierunkowe:
K_K02
Powiązane efekty obszarowe:
T2A_K06