Drukuj Eksport do pliku (MS Word)
Nazwa przedmiotu:
Bioinformatyka
Koordynator przedmiotu:
prof. dr hab. Gładki
Status przedmiotu:
Obowiązkowy
Poziom kształcenia:
Studia II stopnia
Program:
Biotechnologia
Grupa przedmiotów:
Obowiązkowe
Kod przedmiotu:
brak
Semestr nominalny:
1 / rok ak. 2012/2013
Liczba punktów ECTS:
3
Liczba godzin pracy studenta związanych z osiągnięciem efektów uczenia się:
1. godziny kontaktowe 30h, w tym: a) obecność na laboratoriach 24h, b) obecność na wykładach 6h 2. zapoznanie się ze wskazaną literaturą – 20h 3. przygotowanie do egzaminu i obecność na egzaminie – 25h Razem nakład pracy studenta: 24h + 6h + 20h + 25h = 75h, co odpowiada 3 punktom ECTS.
Liczba punktów ECTS na zajęciach wymagających bezpośredniego udziału nauczycieli akademickich:
1. obecność na wykładach – 6h, 2. obecność na zajęciach laboratoryjnych – 24h Razem: 6h + 24h = 30h, co odpowiada 1 punktowi ECTS.
Język prowadzenia zajęć:
polski
Liczba punktów ECTS, którą student uzyskuje w ramach zajęć o charakterze praktycznym:
1. obecność na zajęciach laboratoryjnych – 24h, 2. przygotowanie do zajęć - 6h Razem: 30h, co odpowiada 1 punktowi ECTS.
Formy zajęć i ich wymiar w semestrze:
  • Wykład0h
  • Ćwiczenia0h
  • Laboratorium0h
  • Projekt0h
  • Lekcje komputerowe0h
Wymagania wstępne:
Genetyka, Biologia molekularna
Limit liczby studentów:
brak
Cel przedmiotu:
Po ukończeniu kursu student powinien: • posiadać wiedzę teoretyczną na temat podstawowych problemów bioinformatycznych • dysponować praktycznymi umiejętnościami rozwiązywania prostych problemów bioinformatycznych
Treści kształcenia:
Wykład zawiera wiadomości dotyczące baz danych dla biologii molekularnej i biotechnologii oraz współzależności baz. Przedstawione zostaną podstawowe operacje na jednej sekwencji nukleotydowej, porównywanie dwu sekwencji, metody przeszukiwania baz danych sekwencji nukleotydowych i aminokwasowych przy użyciu sekwencji jako zapytań, porównywanie wielu sekwencji. Omówiona będzie analiza rodzin białek, zaawansowane metody znajdowania podobieństwa sekwencji, motywy sekwencji związane z funkcją, sygnały segregacji do przedziałów komórki, sekwencje kontrolujące ekspresję genów. Przedstawione będą metody sekwencjonowania i składania genomów, odróżnianie kodujących i niekodujących sekwecji DNA (metody ab initio i oparte na homologii), anotacja genomów, genomika porównawcza (na poziomie całych genomów) i funkcjonalna. Omówione będą struktury biopolimerów, zwijanie białek, grafika molekularna – narzędzia, modelowanie struktur białek, oddziaływania białko-białko i sieci oddziaływań, OMIKi i analiza danych eksperymentalnych pochodzących z OMIK oraz biologia systemów.
Metody oceny:
zaliczenie zajęć
Egzamin:
tak
Literatura:
brak
Witryna www przedmiotu:
ch.pw.edu.pl
Uwagi:

Efekty uczenia się

Profil ogólnoakademicki - wiedza

Efekt W01
posiada ogólną wiedzę teoretyczną na temat podstawowych problemów bioinformatycznych
Weryfikacja: egzamin
Powiązane efekty kierunkowe: K_W03, K_W05, K_W07
Powiązane efekty obszarowe: T2A_W05, T2A_W05, T2A_W04, T2A_W05

Profil ogólnoakademicki - umiejętności

Efekt U01
potrafi rozwiązywać proste problemy bioinformatyczne
Weryfikacja: egzamin
Powiązane efekty kierunkowe: K_U01, K_U03 , K_U07
Powiązane efekty obszarowe: T2A_U01, T2A_U05, T2A_U10, T2A_U01, T2A_U03, T2A_U06, T2A_U07

Profil ogólnoakademicki - kompetencje społeczne

Efekt K01
potrafi pracować samodzielnie mając świadomość konieczności stałego pogłębiania i aktualizowania wiedzy.
Weryfikacja: egzamin
Powiązane efekty kierunkowe: K_K02
Powiązane efekty obszarowe: T2A_K06